از کهن ترین مدارس علمیه مشهد بوده که به علت قرار داشتن در ناحیه بالای حرم مطهر امام رضا (ع) به مدرسه بالاسر مشهور شده است. به دستور شاهرخ تیموری ساخته شده و تاریخ نگاران معتقدند که به مدرسه شاهرخی لقب گرفته بود. این مدرسه چندین بار مرمت شده و آخرین بار در سال ۱۳۵۶ ه.ش بازسازی و تعمیر شده است. ایوانهای مدرسه دارای کاشی کاری معرق بوده و کتیبه هایی مربوط به تعمیر مدرسه در زمان صفویان بر آن نقش بسته است.